其实，不管是原料来源，以及对人体的保健作用，鱼油跟鱼肝油的差异颇大。鱼肝油主要来源是鱼的肝脏，最主要的成分是维他命A与D。缺乏维他命A会导致夜盲症及眼球干眼症，虽然鱼肝里富含维他命A，但消费者还是可从一般的食物如蛋黄、牛乳、胡萝卜、家畜肝脏中也可以摄取到。
至于缺乏维他命D时会产生软骨症。一般来讲，人体只要接受阳光照射，就可以自行合成维他命D，然而老年人合成的能力较弱，为了维持骨胳硬朗，就必须注意维他命D的摄取，这时可以考虑利用鱼肝油补充。
鱼油常常跟鱼肝油混为一谈，其实鱼油是深海鱼类脂肪的萃取物，属于油脂类，主要的成分是EPA和DHA的多元不饱和脂肪酸；这类的脂肪酸减缓血液凝结、血块形成以及降低血脂肪之粘稠度。鱼油可当作血管中的清道夫，减少血管阻塞的机率。也就是说，鱼油可预防动脉硬化、肥胖症、高血压、心脏病，增加大脑细胞学习能力及记忆力。
鱼肝油与鱼油使用时千万不能混淆，将鱼油当作鱼肝油吃，由于剂量小，影响较小；但如果将鱼肝油当鱼油吃影响可大了，因为维他命A与D属于脂溶性维他命，长期大量服用鱼肝油，会造成体内囤积过量，无法代谢结果会造成中毒，引起脑压升高，一般民众食用时要特别注意。
